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生物信息学平台



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平台简介 Top

随着高通量实验技术,特别是第二代测序技术的发展,高通量数据的分析和挖掘在现代生物学研究中占有越来越重要的地位。
        生物信息学平台的主要目标是为中心各研究组提供DNA/RNA序列数据、核酸、蛋白质等生物大分子的结构数据、荧光显微镜图像数据等高通量数据的存储,管理,和分析提供技术支持。生物信息学平台装备了高性能的计算设备,存储设备,数据备份设备,以及网络交换设备,可以满足实验数据的快速,准确的分析和安全存储管理的需要。

仪器介绍及原理 Top

The bioinformatics core facility is equipped with high-performance computer servers, including two IBM X3850 X5 servers (each with 8 cores, 128GB RAM) and an IBM Flex system that contains 10 quad-core blade servers (128 GB RAM). The facility is also equipped with three EMC Isilon NL400 storage systems (108TB storage each) and one IBM TS3500 tape storage system.

技术提供 Top
  1. 全基因组DNA甲基化数据的分析
  2. 小RNA数据的分析
  3. 基因表达数据的分析和比较,特别是RNA-seq数据的分析
  4. 基因组和表达组的组装和注释
  5. 基因芯片数据的分析
  6. 比较基因组分析和分子进化
  7. 基因组群体多样性分析
  8. 蛋白组学数据的分析
  9. 模式植物与细胞等功能系统的系统生物学研究
  10. 图像数据的分析
收费标准:

序号
内容
科研单位及高校用户
1
数据存储(课题组目录)2T以内
1000元/年
2
数据存储(课题组目录)超过2T部分
500元/年/T
3
数据存储(个人目录)100G以内
200元/年
4
数据存储(个人目录)101G-500G
300元/年
5
数据存储(个人目录)501G-1T
500元/年
6
数据存储(个人目录)超过1T部分
500元/年/T
7
数据存储(基因平台测序数据)
500元/年/T
8
数据分析(常规分析)
100元/GB
9
数据分析(定制分析)
2000元/样
10
数据库搭建
8000元/库
11
数据库维护
2000元/库/年
12
培训服务
2000/人

 

管理人员及联系方式 Top

平台负责人:傅兴

联系电话:021-57078228

Email:xfu@sibs.ac.cn

平台秘书:郑奇婕

联系电话:021-57078229

Email:qjzheng@sibs.ac.cn